2016年，《国家卫生计生委办公厅关于进一步加强食品安全标准管理工作的通知》明确：“企业标准备案是指卫生计生部门将企业标准中食品安全相关内容材料进行登记、存档、公开、备查的过程。”

需要注意的是，备案不是行政许可，也不是行政审批，卫生行政部门不对备案材料进行实质性审查，只对备案材料及其内容是否齐全、是否属于备案范围进行核对。备案了企业标准并不表示卫生行政部门审查批准了该企业标准。企业是企业标准的第一责任人，对提交备案的企业标准内容等所有材料的真实性、合法性负责，保证企业标准的内容符合《食品安全法》及相关法律法规的规定，不得低于相关食品安全国家标准及地方标准。

依据《中华人民共和国食品安全法》规定，食品生产企业可制定严于食品安全国家标准或者地方标准的企业标准，并报相关卫生行政部门备案。因此，企业标准中的食品安全指标严于食品安全国家标准或者本省/市食品安全地方标准时，需要报卫生行政部门备案；反之，无须报卫生行政部门备案。

根据《关于进一步加强食品安全标准管理工作的通知》：“严于食品安全国家标准、地方标准是指，企业标准中的食品安全指标严于国家标准或者地方标准的相应规定”。比如，饮料类的食品安全指标严于GB 7101《食品安全国家标准 饮料》的相应规定；水果干制品、蔬菜干制品、香辛料类的污染物限量严于GB 2762《食品安全国家标准 食品中污染物限量》的相应规定等。

《北京市食品安全企业标准备案办法》解读中进一步解释为：“增加了食品安全国家标准或者本市食品安全地方标准没有的指标，或者与食品添加剂使用标准、营养强化剂使用标准、食品生产规范不同不能视为严于。”《江西省食品安全企业标准备案问答（第三版）》也有类似的解释：增加食品安全国家标准或者食品安全地方标准对该类型产品没有规定的指标，食品添加剂使用量低于最大使用量，营养强化剂使用量超过规定范围值，严于其它国家标准、行业标准或地方标准，或对指标限量值的调整不能起到提高食品安全保障和消费者健康保护作用等情形，不能视为严于。企业标准中安全指标限值严到什么程度认定为“严于”没有具体规定，但严于的情况是要公示的，备案后的文本是要全文公开的，接受任何单位和个人的监督。